Заступник директора Департаменту – начальник управління організації лікувально-профілактичної допомоги населенню.

1.1 Відділ організації лікувально-профілактичної допомоги дорослому населенню

1.2 Відділ організації лікувально-профілактичної допомоги дітям та жінкам

1.3 Відділ організації стаціонарної допомоги дорослому населенню

Заступник директора Департаменту – начальник управління з організаційно-методичної роботи.

2.1 Відділ організаційного забезпечення, виконання та контролю

2.2 Відділ по роботі зі зверненнями громадян

Заступник директора Департаменту – начальник управління планування, стратегічного розвитку та технічного забезпечення.

3.1 Планово економічний відділ

3.2 Відділ стратегічного розвитку та технічного забезпечення

4. Відділ кадрів

6. Сектор  з надзвичайних ситуацій, медицини катастроф та цивільного захисту